艾灸的作用廣泛，現代研究認為，艾燃燒生成物的甲醇提取物，有清除自由基作用，并且比未燃燒的艾的甲醇提取物作用更強。施灸局部皮膚中過氧化脂質顯著減少，此作用是艾的燃燒生成物所致。艾的燃燒不僅沒有破壞其有效藥物成分，反而使之有所增強。艾燃燒生成物中的抗氧化物質，附著在穴位處皮膚上，通過灸熱滲透進入體內而起作用的。
研究證實，艾灸燃燒時產生的熱量，是一種十分有效并適應于機體治療的物理因子紅外線。根據物理學的原理，任何物體都可以發射紅外線和吸收紅外線，人體也不例外。近紅外線對人體的穿透深度較遠紅外線深，多可達10mm，并被機體吸收。研究認為，艾灸在燃燒時產生的輻射能譜是紅外線，且近紅外線占主要成分。近紅外線可激勵人體穴位內生物分子的氫鍵，產生受激相干諧振吸收效應，通過神經-體液系統傳遞人體細胞所需的能量。艾灸時的紅外輻射可為機體細胞的代謝活動、免疫功能提供所必需的能量，也能給缺乏能量的病態細胞提供活化能。而艾灸施于穴位，其近紅外輻射具有較高的穿透能力，可通過經絡系統，更好地將能量送至病灶而起作用。
艾灸的好處還用于內科、外科、婦科、兒科、五官科疾病，尤其對乳腺炎、前列腺炎、肩周炎、盆腔炎、頸椎病、糖尿病等有特效。其次，艾灸具有奇特養生保健的作用。
進入現代社會之后，針療不斷得到發展，而艾灸卻受到了人們的冷落。艾灸在施治過程中，燒灼患者經穴，會在身體上留下施灸的疤痕。
灸學大師周楣聲先生指出，正是病痛與灸瘡帶給患者的雙重痛苦，使得艾灸一蹶不振，并呼吁對艾灸深入研究，推進艾灸的現代化發展。
近年來，隨著人們對艾灸療效獨特性的認識，艾灸療法重新得到了醫學界重視，現代化研究的步伐也在加快。現代的溫灸療法，并不直接接觸皮膚，采用艾條懸灸和艾灸器溫灸的方式作用治療疾病保健養生只用，效果也很好。并具有使用方便，操作簡單，不會燒灼皮膚產生疤痕的特點。
艾灸為身體補充陽氣，尤其適用于陽虛體質。艾灸有補瀉的作用，對于陰虛火旺熱癥體質的人，要先從瀉法開始，滋陰的同時再調理陰陽的平衡.
灸法是利用艾絨在體表穴位上的燒灼，借助灸火的溫和熱力和藥物的作用、腧穴的功能，通過經絡的傳導，起到溫通氣血、扶正祛邪的作用，達到治療疾病和保健目的的一種外治法。
清代吳儀洛著《本草從新》中記載艾葉“苦辛，生溫，熟熱，純陽之性，能回垂絕之陽，通十二經，走三陰，理氣血，逐寒濕……以之灸火，能透諸經而除百病?！币馑颊f：艾絨制成的艾炷，能使熱氣內注，溫煦氣血，透達經絡，并且艾灸一些具有補益強壯作用的穴位，故而能夠達到扶正祛邪，強身保健的作用。保健灸法是自古以來的防病之術。
要使身體健康平安，常灸足三里穴，勿使灸瘡干燥，結痂愈合，這是古代醫療長期實踐中得出來的經驗總結。又如灸風門穴可預防感冒，常灸曲池穴、中脘穴、足三里穴、大椎穴、脾俞穴、腎俞穴、陽陵泉穴、三陰交穴都可以起到保健作用。
現代醫學實驗研究證明，灸法可以調整臟腑功能，促進新陳代謝、改變血液成分，增加白細胞、血色素、紅細胞數量和白細胞的吞噬功能，加強免疫力，提高機體的抵抗力，從而起到預防保健的作用。
艾葉能宣理氣血，溫中逐冷，除濕開郁，生肌安胎，利陰氣，暖子宮，殺蛔蟲，灸百病，能通十二經氣血，能回垂絕之元陽。用于內服治宮寒不孕，行經腹痛，崩漏帶下。外用能灸治百病，強壯元陽，溫通經脈，驅風散寒，舒筋活絡，回陽救逆。
