5、其他區別
正在使用激素的寶寶與小兒手足口病的患兒接觸，不會病情加重;而與水痘患兒接觸，則會使他們的病情很快加劇。
與其他病毒所致腦炎或腦膜炎相鑒別
臨床表現與手口足病合并中樞神經系統損害的重癥病例表現相似。
與脊髓灰質炎相鑒別
脊髓灰質炎的主要表現為雙峰熱，在發病之后的第二個星期退熱之前或者正在退熱的過程之中會出現弛緩性癱瘓，但是并無皮疹。
流涕和流口水等像上呼吸道感染一樣，有的孩子可能有惡心、嘔吐等癥狀。以后手、足的指及趾背部出現橢圓形或梭形的水泡，皰的周圍有紅暈，水皰的液體清亮，水皰的長軸與皮紋是一致的。然后水皰的中心凹陷、變黃、干燥、脫掉(脫屑)。另外指、趾端有散在的比較堅硬的淡紅色丘疹或者皰疹。
同時，在口腔里，如嘴唇、舌、口腔粘膜、齒齦上也有散在的水皰，但口腔里的水皰很快破潰而形成灰白色的小點或灰白色的一層膜，其周圍有紅暈，在灰白色的膜下可以見到點狀或片狀的糜爛面。手足口病是由病毒感染引起的，感染源為皰疹液、咽喉分泌物、糞便污染的手、玩具、食具等。它的潛伏期是3—8日。
能引起手足口病的病毒包括柯薩奇(COXAOHIE)病毒A組16、5、9、10型，B組2、5型，新腸道病毒71型以及皰疹病毒、腺病毒等。本病全年都可發生，其中6～8月份為發病高峰。
手足口病起病一般較急，患兒常有發熱，體溫38℃～40℃，熱程多為4～7天，7天以上者少見。病初部分患兒多伴有流涕、咽痛、厭食、嘔吐、腹瀉等癥狀。病后不久在患兒手足遠端部位如手指、手掌、足趾以及口腔出現紅色小丘疹，并迅速轉為小皰疹，直徑2-4mm，如米粒大小，呈圓形、橢圓形，周圍有紅暈。
