這些片面甚至錯誤對待中醫藥發展的思想和做法，引起了毛澤東、劉少奇等中央領導同志的警惕和批評。1953年，毛澤東在對衛生工作的指示中指出：“看不起中醫是不對的，把中醫說得都好太好，也是錯誤的”，“我們對中醫須有全面的正確的認識。必須批判地接受這份遺產。必須把一切積極因素保存和發揚”。1954年6月底7月初，毛澤東對中醫藥工作發表講話，指出，“中西醫比較起來，中醫有幾千年的歷史，而西醫傳入中國不過幾十年，直到今天我國人民疾病診療仍靠中醫的仍占五萬萬以上，依靠西醫的則僅數千萬(而且多半在城市里)。因此，若就中國有史以來的衛生教育事業來說，中醫的貢獻與功勞是很大的。祖國醫學遺產若干年來，不僅未被發揚，反而受到輕視與排斥，對中央關于團結中西醫的指示未貫徹，中西醫的真正團結還未解決，這是錯誤的，這個問題一定要解決，錯誤一定要糾正。首先各級衛生行政部門思想上要改變。”

　　1954年7月，劉少奇專門召集衛生部司局長及各大區醫學工作者代表座談中醫工作。他嚴厲批評了醫療界歧視和排斥中醫的錯誤做法，指出“看不起中醫，是奴顏婢膝奴才式的資產階級思想;歧視、排斥中醫是一種極端卑鄙的惡劣的資產階級心理的表現，這種狀況，極大地阻礙了我國醫藥學遺產的研究和發揚”。他還在不同場合要求給予中醫以應有的地位。例如，他要求衛生部“要主動團結中醫，歡迎他們，給他們以應有的地位”，“對中醫和西醫要一視同仁”，“不能鄙視、歧視中醫，要尊重中醫，國家要給中醫以幫助”。

　　為了全面糾正影響中西醫團結的錯誤傾向，毛澤東和黨中央采取了一系列重大措施。1954年7月，成立了由中宣部、文化中央教育委員會、衛生部指定人員組成的中醫問題臨時工作組，向各地衛生行政負責人和北京、天津的中西醫傳達中共中央關于中醫問題的指示;召開了中共中央、華北和北京市各有關部門的中西醫座談會，反復討論了關于學習和研究中醫、擴大中醫業務、出版中醫書籍等問題。1954年10月20日，《人民日報》發表了題為《貫徹對待中醫的正確政策》的社論，認為發展中醫就是“如何通過認真的學習、研究和實踐，逐漸使它和現代科學理論相結合的問題，就是要根據現代科學的理論，用科學方法來整理中醫學的學理和總結它的臨床經驗，吸取它的精華，去掉它的糟粕，使它逐漸和現代醫學科學合流，成為現代醫學科學的重要組成部分”。1954年11月，中共中央批轉國務院文委黨組《關于改進中醫工作的報告》，進一步闡明了黨的中醫政策，提出了改進中醫工作的具體措施。衛生部對自身不能正確對待中醫的思想和做法進行了反省和檢查，并于1955年2月2日發出《關于取消禁止中醫使用白紙處方規定的通知》，旨在取消對中醫行醫的限制。1956年11月27日，衛生部發布了《關于廢除中醫師暫行條例的通令》。至此，中醫藥事業開始走上穩步發展的軌道。

　　(三) 提倡中西醫結合，為中西醫的團結合作指明方向

　　早在延安時期，毛澤東就談過“中西醫結合”的問題。1944年5月24日，他在延安大學的開學典禮上就講到：“我們邊區政府的副主席李鼎銘同志是中醫，還有些人學的是西醫，這兩種醫生歷來就不大講統一戰線。我們大家來研究一下，到底要不要講統一戰線?我不懂中醫，也不懂西醫，不管是中醫還是西醫，作用都是要治好病。治不好病還有醫術問題，不能因為治不好病就不贊成中醫或者不贊成西醫。能把娃娃養大，把生病的人治好，中醫我們獎勵，西醫我們也獎勵。我們提出這樣的口號：這兩種醫生要合作。”

　　新中國成立后，毛澤東更加重視“中西醫結合”、“團結中西醫”這一問題。1950年8月7日，第一次全國衛生會議在北京召開，會議提出了“面向工農兵”、“預防為主”、“團結中西醫”三大衛生工作方針，毛澤東親自為會議題詞：“團結新老中西各部分醫藥衛生人員，組成鞏固的統一戰線，為開展偉大的人民衛生工作而奮斗。”毛澤東的這一指示為中西醫結合、彼此間團結合作指明了方向。1951年6月，劉少奇也表示：“政府目前的政策是團結中醫西醫，共同為人民服務，同時設法提高中醫……使他們能更多的解決人民疾病問題。”